La chiesa di San Sebastiano si trova in Piazza Municipio a Ceccano ed è stata costruita nel XIV secolo per volere di Annibaldo IV de Ceccano.
Il Cardinale dispose nel suo testamento (1348) la costruzione di una chiesa appena fuori le mura che venisse affidata ai frati Minori.
All’inizio del XVI secolo, con l'arrivo dei Colonna, la chiesa venne riedificata in stile barocco e poi riaperta ai fedeli nel 1597.
Dal 1868 la struttura fu affidata alle Suore di Carità che ne avviarono una vera e propria opera di trasformazione. Le religiose lasciarono la chiesa nel 1969.
L'interno è ad un'unica navata con due altari laterali decorati con affreschi del XVII secolo.
Sull’altre di sinistra è dipinto un affresco raffigurante le stigmate di San Francesco, mentre sull’altare di destra uno raffigurante la Natività, incorniciato in alto da una decorazione con lo stemma araldico del Cardinale Maurizio Caetani.
Dietro l’altare maggiore si trova una parete divisoria decorata con icone e arricchita con stucchi dorati ed affreschi del XIX secolo.
In una nicchia al centro della parete è ospitata la statua di San Sebastiano del XVI secolo e, nella parte superiore, si trova una statua della Madonna.
Da notare il piccolo organo da processione che veniva portato per le vie del paese durante le feste religiose. Si tratta di un unico esemplare esistente nel basso Lazio.
Lo strumento fu commissionato alla bottega organaria "Catarinozzi-Spadari" di Affile (Roma) in ricordo del Giubileo del 1775.
E’ stato restaurato nel 2003.
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